آموزش کار با ژل اگاروز

در حال حاضر آگاروز و پلي كريل آميد متداول ترين و پر كاربردترين ماده به عنوان واسط در الكتروفورز ژلي محسوب مي شوند. در اغلب دستگاه‌هاي الكتروفورز، ژل مابين دو محفظه بافري قرار مي گيرد به طوري‌كه ژل تنها واسطه در عبور جريان الكتريسيته بين اين دو محفظه باشد. هر دو شبكه خلل و فرج داري توليد مي كنند كه ميكرومولكول‌هايي بارداري را كه در پاسخ به ميدان الكتريكي جابه جا مي شوند در خود جاي مي دهند. به عنوان مثال زماني كه جريان اعمال مي شود، DNA هاي با بار منفي به سمت الكترودهاي باردار مثبت حركت مي كنند. خلل و فرج هاي موجود در شبكه ژلي انتقال مولكول‌هاي بزرگ را محدود مي كنند و اين در حالي است كه مولكول‌هاي كوچك‌تر با آزادي بيشتري منتقل مي شوند و در فاصله دورتري از الكترودها قرار مي گيرند. اين غربال مولكولي مولكول‌ها را بر مبناي سايزشان جدا مي كند.